声音
没有声音，在/etc/modprobe.d/modprobe.conf里加入：
options snd-hda-intel model=mbp3 position_fix=2
网络
dhcpcd禁止ipv6:
在/etc/dhcpcd.conf中加入:
noipv6rs
noipv6
看到一个帖子, https://www.maketecheasier.com/make-arch-linux-more-stable/， 说避免老升级内核，用lts版，装完可以把原先内核干掉：
sudo pacman -S linux-ltsWhen you’ve installed the LTS kernel, it’s a good idea to remove the bleeding edge kernel from your system.
sudo pacman -R linux
我内心闪过一个想法，难道不用配置启动么？也没去确认，照做后重启，你妹啊，太坑了，直接就找不到内核死掉！
Disease ontology (DO) annotates human genes in the context of disease. DO is important annotation in translating molecular findings from high-throughput data to clinical relevance. DOSE is an R package providing semantic similarity computations among DO terms and genes which allows biologists to explore the similarities of diseases and of gene functions in disease perspective. Enrichment analyses including hypergeometric model and gene set enrichment analysis are also implemented to support discovering disease associations of high-throughput biological data.
首先基因下游是什么？
我们知道上游很重要啊，因为可能会调控转录，但注释的时候，没有上游这个东西，为什么呢？因为转录起始位点TSS的上下游被定义为promoter，所以啊上游被包括在promoter中，也就没有上游这个category了。
我在2018年4月份的一条推特文，https://twitter.com/guangchuangyu/status/988672880551518210，可以把UpSetR变成ggplot然后可以各种玩，比较我在推特文中所展示的，图上嵌入venn图、使用cowplot拼图等。然而过了大半年，我的pull request并没有被作者接收，也就是说这功能还不存在于官方的版本中。
如果有兴趣的话，应该安装我fork的版本。
devtools::install_github("GuangchuangYu/UpSetR")
生物狗喜欢画barplot，但毕竟只有均值和标准误差信息量太低，万一有outliers呢？万一不是正态分布呢？所以就吐槽了又吐槽，但大家还是乐此不疲，因为大家都在用，因为很多人只会画barplot，所以产生各种反barplot运动，并呼吁大家使用boxplot，boxplot有四分位数的统计量，可以反应outlier和数据的分布，比barplot高得多了。
然而事情是不断在进化的，我们的手段是要跟上潮流的，现在的潮流就是除了要有统计量，还要有原始数据，甚至于有统计推断，全集中一图中，揭开数据的红盖头，给大家呈现全方位无死角的面貌。
小伙伴发来这个图，问我是不是bug，这真是犯了程序员的社交礼仪。
你如果对一个程序员说，“你的代码有bug。” 他的第一反应是：
- 你的环境有问题吧
- 傻逼你会用吗。
如果你委婉地说：“你这个程序和预期的有点不一致，你看看是不是我的使用方法有问题。”
他本能地会想：“操，是不是出bug了！”
这显然不是bug，这是绝大多数人对ggplot2的误解，他们认为用xlim和ylim是放置一个窗口去看你的图，然而在ggplot2是限定一个窗口去过滤你的数据，并重新画图！你的数据被过滤了！如果是放置窗口在图上，一条线从A到B，如果B在窗口之外，那么线被截断了，你看到半条线，但如果是过滤数据呢？B不复存在，那么线条A到B也不复存在，没有B，A到B的线画不出来。就是这样，所以这绝逼不是bug，而是程序员本能反应的第二种情况，你用错了。
那么怎么样不过滤数据，而只是设置可视化窗口呢？你基本上很少看到有人这么用，因为几乎99%的人都只知道xlim和ylim，一般人我也不告诉他，快点拿去小抄把下面的代码记录一下。
