《你昨天才做的分析，可能是几年前的结果！》这篇文章给大家敲了警钟，各种各样的web-server，要小心看有没有维护更新，有些是五年十年都不更新的，十分可怕。文章虽然讲的是富集分析，但其它分析工具你同样需要小心。

当然并不是说独立的软件/软件包就一定靠谱，如果软件自己打包了数据，同样要注意数据是否有更新，而如果数据不打包在软件里，而是在线获取，你同样也该留一下心。这也是clusterProfiler做富集分析的优势所在，KEGG数据是在线的，永远是最新的，而GO的数据不在软件包里，而依赖于别的数据包，而这些数据包是社区维护的（相对而言，个人的维护比较难以为继），就确保了数据一直在有更新维护的。

Bioconductor每半年发行一次，注释包同样每半年更新一次，所以你用clusterProfiler做GO分析，你用的GO数据库不会说超过半年没更新，而不像有些公司给出的结果，落后于这个世界不是一年两年这么简单。

Bioconductor最近一次是10月31号发布的3.6版本，如果你还没更新，是时候看一个《Update R packages》然后来一发了，如果你更新了，也要再来一发，因为我上次的掐架，《请用事实怼我 -,-》，为社区带来了好多注释包的更新。

用clusterProfiler的好处还在于你是知道GO数据的更新日期的，上一次《请用事实怼我 -,-》的时候，我发现GO的数据还是2017年3月份的，证明10月份发布新版本的时候没更新，我就去Bioconductor说他们没更新，所以说是掐架带来的bonus，给社区做了点贡献。这也是我说的社区维护的好处，用户反馈是非常有用的，而且在帮助自己的同时，也帮助了大家。

在我的push之下，数据源终于更新到了2017年11月6号，当然KEGG的数据永远定格在2011年3月15号。

而《请用事实怼我 -,-》里某公司的分析，已经是几年都没更新了，肯定之前是有客户发现的，然而就像某公司员工出来掐一样，先是客户无知，他们肯定、必须是最新的。在打脸之后，说什么：可能跑流程的人没有改参数。尼马我还能说什么呢。而且做科学不是用数字说话，不是用事实说话，而是他做为某公司员工，要为「科学共同体」打call，厉害了，听得我一脸蒙逼。