2016潮博沙龙

潮博沙龙》系受到潮博群里大家的邀请,应邀去普及一下生信以及介绍自己的一些经历。

2016中国R语言大会

中国R语言大会,我到目前为止,只参加过2016年那一次,也就是第9届,那也是首次有Bioconductor分会,并且还邀请了bioconductor的老大martin morgan,我当时也是受邀请去参会的,虽然会议在人民大学举行,虽然主会场和其它分会场都是讲中文,但bioconductor分会场是要求讲英文的。因为主讲人一半是歪果仁,一半是中国人,而3个中国人之中又有两个是美帝来的,只有我一土鳖。本来邀请人跟我提了一下ChIPseeker,暗示可以讲这个包,但我强行去讲ggtree,然后会后,很多听众问我clusterProfiler的问题,也是挺尬聊的。

2017年进化树可视化

2017年受邀请去美国自然历史博物馆讲ggtree,这是field museum内部邀请举行的一个内部的会议,由他们的NSF基金资助,我带着统统一起去,省掉了统统去参观博物馆三十多刀的门票。被邀请都是在进化树可视化上有重要作品的人,讨论的是进化树可视化未来的发展,有很多都是大佬,比如写Mesquite的David Maddison,他还有个双胞胎兄弟,Wayne Maddison,两兄弟是进化界的翘楚,NEXUS格式做为进化树的储存格式就是他们兄弟俩提出来的。

Maddison DR, Swofford DL, Maddison WP (1997). “NEXUS: An extensible file format for systematic information”. Systematic Biology. 46 (4): 590–621

当时我走在路上,看到David Maddison,还在讲“估计前面的老人家也是来这里参加这个会议的”,不认识大佬的我,真是太囧了。

还有写phytools的Liam J. Revell,他私下问我要不要去美国做博后,被我无情地拒绝了,我跟他说我想在中国发展。

我是被邀请参加的唯一一个博士生,他们都很惊讶我竟然还没毕业,也对ggtree是由我自己一个开发的,表示惊讶。

2017年环境微生物

环境微生物的会其实是找工作的,当时联系了中大环境学院,一切都挺OK,但最终在学校层面被拒了,卡我没有两年的博士后经历。当时讲的主要也是我博士期间做的东西。后来年底又申请了中大医学院,但他们院长竟然忘记提交我的申请,来年我询问说忘记了,叫我联系某某老师,我也是服了。

2018南医大找工作啊找工作

Y叔要求职》一文发出来之后,南医大有不少人联系我,3月份我来到了南医大,做了一次报告,然后我就确定来南医大工作了。机遇就在转角处,本来我都没关注南医大,但有时候就是这样,有机会也有贵人。

2018南湖论坛

华中农的南湖论坛,其实也是找工作的,有国外的教授推荐我去,我说我没有去武汉工作的意向,教授对我说,谁说一定要去工作的?去推销一下自己的工作,认识些新朋友就挺好,于是我就去了,顺道带着在武汉读大学的统统去重走青春路。我本来报的不是信息学院,据说被强行选去信息学院讲。我当时讲的是treeio + ggtree。就在我到武汉的第二天,我收到了南医大的offer,而第三天,我收到了中大医学院面试的通知,然后我告知他们,我已经拿了offer,reject他们的面试。

2019南医大基础医学院年会

刚来就被拉出来溜溜,刚好讲MBE上的文章:《文章发表:两种方法在进化树上可视化数据》。