Usually Roche’s installer is a catastrophe, they only provides rpm packages of the software for 454 GS FLX (version 2.9). Although the package contains setup.sh, the script is useless since it is actually a binary payload. I run the setup.sh, and it throw error of not finding /sbin/lspci. In debian derived distribution, lspci command is located in /bin folder. This issue is easy to solve by adding a soft link to /sbin/lspci.

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上个月写了《使用ggplot画图》一文,图片太多,一下子把博客的12G流量给用光了,月中博客就被停了,小伙伴们太给力了,blog不能访问,真是件不爽的事情。

言归正传,从2002年使用redhat 7.1开始,就没中止过使用linux,为什么要说again呢,因为在过去几年的工作时间里,使用的是OS X和win7做为桌面的,linux只在服务器端使用。自从用了OS X之后,就不想再用linux当桌面了,OS X绝对是节省生命的系统,本身是unix-like系统,对各种桌面软件支持又好,特别是中华大地,linux还是小众,用来当桌面实在是各种坑。

不过现在又回到学生时代了,所以还得继续学生屌丝的折腾,本科时从redhat,debian到gentoo,硕士时实验室的机器用ubuntu,而笔记本用NetBSD。这么多年的使用,该有的坑都填了,但是时代在发展,新坑还是不断有的,使用百度云来同步化文献库,就是最近的新坑,装上linux之后,发现度娘没有客户端,首先想到的当然是wine,wine出来的偶尔能行,时常崩溃,跟它死磕我也会崩溃,github上寻找开源实现,各种功能缺失和限制,那就只能虚拟机了,把home目录做为共享盘,挂到虚拟机中,但是度娘一直都是占100% CPU,然后数据无法同步,只有两个原因,不是硬盘就是网络,感觉好像我一个分区800G太大了,但在虚拟中对硬盘读写正常,网络因为使用NAT,虚拟成内网,有可能是这个原因,于是换成bridge,把虚拟机当成现实网络中的另一台主机,但度娘依然只占CPU,不干活。那只能还是硬盘问题,最后问题解决了,通过在linux中提供samba服务,然后在虚拟机中通过网上邻居把共享目录映射成网络驱动器,这时候度娘终于肯干活了。都不知道是virtualbox的驱动有问题,还是度娘太挑,这太TM坑了。

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机房放着台机架机,闲着也是耗电,平时偶尔用putty登上去,没有图形界面还是有些不方便。

搜了一下,发现好几个软件可做这样的事,Xming是开源的,所以选择使用Xming+putty来远程连linux的桌面。

试用了一下,果然不错。

需要修改/etc/ssh/sshd_config,添加:

X11Forwrding yes

需要配置一下PuTTY,Connection-SSh-X11中选中Enable X11forwarding 其中X display location里填入localhost:0

运行Xming,再用putty连到服务器上,运行程序,就OK了。就好像windows下的本地程序一般。整合性很好。

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powerbook笔记本装Mac OSX 10.2,我嫌太慢了,就装了gentoo,所有的东西都是从软件编译,费了很长的时间,CPU太慢了。原来的硬盘只有10G,后来我又换了60G的硬盘,就是现在要备份数据的硬盘了。换硬盘的时候,没有换系统,我从livecd里进去,把系统打包,并对新硬盘进行分区。然后拆机换硬盘,还是从livecd进去,把新硬盘格式化,把原来的硬盘挂上去,把打包的系统解压到新的分区里,并初始化一些系统的设定,把用户数据拷进去。换硬盘不换系统。这个当时没记录下来。后来有一次手痒,重新编译了glibc,把其它的local都去掉,只留下中文的。可是这一次搞了有问题,系统总有点莫名其妙的问题。

06年,我就想换个系统算了。找人刻了张os9.2的盘,自己刻了张netbsd的盘。装双系统

os9.2可以用微软的office 2001,还有ie5.5,不过都不是很好用。最爽的是可以用很多做图软件,photoshop,coredraw,illustrator等等啊。当年在合肥还帮很多同学处理过照片,因为6级考试要上传的图片要求是10k以下,很多人压到10k都看不清了,我用photoshop压到10k还能看清人.^_^.

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用PITA算法做靶标预测的时候,要用到ViennaRNA包做结构的折叠,这个包是被修改过的,原来的包在我机子上是可以装的。但是这个修改过的包编译不通过。很奇怪的错误,不知道怎么改。

好在它有两个版本,64位和32位的。我弄到大型机上去编译32位的,也是出错,不过是命名空间的问题,我改两个头文件就可以通过了。最近又要算。那个大型机最近被搬走了。只能本机上做。

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用了好多年linux,现在用windows越来越少了,但是还是得用。没办法,上taobao买个东西,上网银都得用ie,有时候还得用office等其它一些软件。

实验室里有台机子是做文件服务的,装的是windows 2003 server。之前使用rdesktop远程桌面,最近发现配合seamlessrdp可以让rdesktop实现更好的效果,运行windows程序,就像linux中原生程序一样。。

> [下载
> seamlessrdp.zip](http://www.cendio.se/files/thinlinc/seamlessrdp/seamlessrdp.zip)
> 解压丢在C盘。

在linux下运行这样的指令

> rdesktop -A -s "c:\\seamlessrdp/seamlessrdpshell.exe C:\\Program
> Files\\Internet Explorer\\iexplore.exe" ip:3389 -u administrator -p
> password

就可以在linux下运行服务器端的ie了。windows下所有程序都没问题。

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Guangchuang Yu

Bioinformatics Professor @ SMU

Bioinformatics Professor

Guangzhou