这个问题是以弗拉维奥·约瑟夫斯命名的，它是1世纪的一名犹太历史学家。他在自己的日记中写道，他和他的40个战友被罗马军队包围在洞中。他们讨论是自杀还是被俘，最终决定自杀，并以抽签的方式决定谁杀掉谁。约瑟夫斯和另外一个人是最后两个留下的人。约瑟夫斯说服了那个人，他们将向罗马军队投降，不再自杀。约瑟夫斯把他的存活归因于运气或天意，他不知道是哪一个。 – https://zh.wikipedia.org/wiki/约瑟夫斯问题
这是一个比较简单的问题，n个人围成圆圈，越过k-1个人，杀掉第k个人，如此反复直到只剩下最后一个人。可以用数学推导给出答案，问题本身已经足够简单，用链表可以模拟整个过程。实现起来比较直观。这里在初始化这个链表的时候，需要注意，到了最后一人的时候，他应该指向第一个人，这样才能形成一个环状的链表，然后问题就非常简单了，从第一人开始，后面就无所谓头和尾了，按照规则来，每次杀掉一个人，直到只剩下最后一人，就是结果。从维基的解释可以看出，最后两个人没死，这没节操的事情被拿来说，如果你数学好，你就可以救自己一命（站在合适的位置，让自己是最后一个）。
之前帮助高老师实现比对序列的做图，把代码打包为R包seqcombo，方便安装使用。花两小时的作品，发现还有些用户在使用 -，-
之前有人联系我说安装不上，我觉得不应该有这个问题，因为是纯R代码代码，不涉及到编译，源码包安装不应该有问题。但既然有人问，又都是windows用户，我想可以给他们提供编译好的windows包，简化安装过程（这么体贴用户，我都要被自己感动了）。
放在CRAN或Bioconductor上的R包，CRAN和Bioconductor会编译出不同平台的二进制包，但seqcobo放在github上，只有源代码，没有预编译好的包，但没有不是问题，我编译好放上去就行了。
但问题是我没有windows！多年来一直是OSX和linux，MacBook Pro跑Arch Linux，一台iMac跑OSX，我自己根本没有跑windows的机器，所以难为无米之炊，借台机器总是有的，但总不能每次一更新，就拷个代码去别人的机器上打包，再拷回来上传到网上，想想也是蛋疼。
所以没有windows，这事干起来还不太容易，！在想怎么来无中生有生出个windows包出来的时候，我想起了rhub，也是因为没有windows，之前就用rhub来进行windows平台的R check，在把代码push到CRAN或Bioconductor之前，我总会测试没问题了，再提交代码过去，而rhub正好可以给我提供windows平台的检测。
https://twitter.com/kurai_yousei/status/799532564633518080
这个Diego在推特上问的问题，他最近在写一个motiftools的R包，里面用了ggtree来画图，我想他应该是要解决他在包里的画树/聚类功能吧。
他问题写的horizontal，但其实plot.hclust默认是vertical，ggtree默认也是horizontal，所以我认为他问的是vertical layout，这个在我的回答中也得到了他的确认。
周末Bioconductor上的问题，说的是他用了buildGOmap之后，在终端上输出了一长串，但没有文件产生，今天就来讲讲这个buildGOmap的前世今生。
当年写clusterProfiler的时候在暨大工作，主要也是自己的需求驱动，因为实验室里有做细菌，比如肺炎链球菌D39，在细菌界基本上所谓的GO分析，就是跑个电子注释，然后数一下数目，列个表格画个饼图。很难看到有富集性分析的身影，因为绝大多数的工具是只支持少量模式生物的，还有部分工具比如支持某些细菌，支持某些植物或者某些真菌，比如支持植物的，也只是支持少量的植物物种而已，都是些自己定制给自己用的玩意，放出来只是为了顺道灌水而已。
画图配色并不是一件简单的事情，好的配色让人眼前一亮，虽然R有很多配色方案，做为ggplot2的爱好者，ggthemes也提供了很多主题，内置了很多配色方案，还有一些其它的包，比如ggtech，包含了一些科技公司比如facebook, twitter, google的典型配色方案，甚至于ggsci，提供了nature, lancet的配色方案。
但这些远远不够！ 但这些远远不够！ 但这些远远不够！
看到一张图片让我眼前一亮，我想用它的配色方案呢！我想拿最新电影的海报的配色来装个逼呢！画图时不想用现成的配色，想要另类一些，我想用一些大自然的风格，比如求偶期间各种鸟类的羽毛颜色来画！
这些在R里面，都是可以的，可以的，可以的…
