对于生信狗,天天黑白命令行,实验室的同事,经常对着我的Emacs说,这么小的字体你看得清吗?我只能无奈地回答,因为我要一个屏幕显示一整个函数。我自己平时写代码也很注意这一点,函数尽量小,太长就要考虑切分成几个函数,我说自己是脑容量不够,写不了长函数。我希望如果有人看我代码,他/她可以看得舒服点,虽然写的不见得好,但起码一个函数,你一个屏幕是装得下的。岁月留给我们的,是越来越厚的镜片!然而最近有一款神器,让我们在命令行里,可以高亮显示生物学常见的数据格式,包括SAM, VCF, GTF, PDB和FASTA。这款神器叫bioSyntax (http://bioSyntax.org) ,看着舒服多了,而且逼格十足,如果大家序列比对看多了,其实都会依赖于看颜色,黑白字体情况下,你很难去区分ATCG,即使有明显的pattern,你也很难看出来。

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Guangchuang Yu

Bioinformatics Professor @ SMU

Bioinformatics Professor

Guangzhou