安装Amos

Amos是纯于比较难安装那种,因为依赖关系比较复杂。

首先编译需要qt4-devboost graph toolkit

sudo apt-get install libqt4-dev
sudo apt-get install libboost-graph-dev

再者是perl模块:

sudo cpan -i DBI
sudo cpan -i Statistics::Descriptive

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Usually Roche’s installer is a catastrophe, they only provides rpm packages of the software for 454 GS FLX (version 2.9). Although the package contains setup.sh, the script is useless since it is actually a binary payload. I run the setup.sh, and it throw error of not finding /sbin/lspci. In debian derived distribution, lspci command is located in /bin folder. This issue is easy to solve by adding a soft link to /sbin/lspci.

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上个月写了《使用ggplot画图》一文,图片太多,一下子把博客的12G流量给用光了,月中博客就被停了,小伙伴们太给力了,blog不能访问,真是件不爽的事情。

言归正传,从2002年使用redhat 7.1开始,就没中止过使用linux,为什么要说again呢,因为在过去几年的工作时间里,使用的是OS X和win7做为桌面的,linux只在服务器端使用。自从用了OS X之后,就不想再用linux当桌面了,OS X绝对是节省生命的系统,本身是unix-like系统,对各种桌面软件支持又好,特别是中华大地,linux还是小众,用来当桌面实在是各种坑。

不过现在又回到学生时代了,所以还得继续学生屌丝的折腾,本科时从redhat,debian到gentoo,硕士时实验室的机器用ubuntu,而笔记本用NetBSD。这么多年的使用,该有的坑都填了,但是时代在发展,新坑还是不断有的,使用百度云来同步化文献库,就是最近的新坑,装上linux之后,发现度娘没有客户端,首先想到的当然是wine,wine出来的偶尔能行,时常崩溃,跟它死磕我也会崩溃,github上寻找开源实现,各种功能缺失和限制,那就只能虚拟机了,把home目录做为共享盘,挂到虚拟机中,但是度娘一直都是占100% CPU,然后数据无法同步,只有两个原因,不是硬盘就是网络,感觉好像我一个分区800G太大了,但在虚拟中对硬盘读写正常,网络因为使用NAT,虚拟成内网,有可能是这个原因,于是换成bridge,把虚拟机当成现实网络中的另一台主机,但度娘依然只占CPU,不干活。那只能还是硬盘问题,最后问题解决了,通过在linux中提供samba服务,然后在虚拟机中通过网上邻居把共享目录映射成网络驱动器,这时候度娘终于肯干活了。都不知道是virtualbox的驱动有问题,还是度娘太挑,这太TM坑了。

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Guangchuang Yu

Bioinformatics Professor @ SMU

Bioinformatics Professor

Guangzhou