连遮羞布都不要,难道这是个一被子的故事?

事情开始于我整理并曝光了西安电子科技大学一个讲师读在职博士期间抄袭了两篇文章,并顺利拿到学位晋升为副教授的故事。

这个故事很精彩

亮点1: 期间发现了一条抄袭链,GOSim被DOSim抄,而DOSim又被HPOSim抄,抄袭者都在文章中把抄来的算法实现当成自己做的东西来介绍。

亮点2: ppiPre抄袭GOSemSim的文章,我跟BMC Systems Biology反馈了,而编辑部竟然各种包庇,最后抄袭者两面三刀,和编辑部黑箱操作,在未告知我的情况下,出来一个洗地的Erratum,把抄袭说成不好意思,忘记引用了。

整个过程连载于以下四篇文章中:

如果想要分享这整个过程,可以分享以下这个汇总的文章:


这个事情之所以精彩,还在于做为同行的华中科技大学薛宇教授,在科学网上发表文章,各种偷换概念,各种论据与论证不相关,强行为抄袭洗地。

徐洲更同学当天写了文章回应:

对于这种洗地洗到裤衩都不要的情况,我也是实在看不下去,只能为他们送出祝福:


然而事情还没完,X教授还是要以长辈的身份来跟大家普及一下《如何姿势正确的使用他人代码?》,手法如一,无非是偷换概念、论据与论证不相关。

GOSemSim做的是GO分析,ppiPre做的是相互作用预测,即使这两个代码相似度在99.9999999999%,那ppiPre也必然有自己独到的东西,不然如何能预测蛋白质的相互作用?所以抄袭是不存在的。

像上面这样的话也可以说,我只能说呵呵,X教授也列举了他自己以「正确的姿态」使用别人的代码,当然他自己也说了自己从不开源,只做webserver和database。做为webserver,是可以通过整合别人的工具来实现的,这不需要什么「原创性」,也不是什么scientific research,重点只在于降低门槛,提供有用的工具或流程。X教授当年博士毕业半年,就是以两篇NAR的webserver拿了中科大的副教授。对于拿来主义,大概也是深谙此道的!所以他是有资格来跟我们这些晚辈普及使用他人代码的正确打开方式的,大家肯定受益良多,X教授以亲身经历为我们打开了生信灌水的大门。

X教授所说的姿势正确,且不说里面有多少模糊概念甚至于偷换概念的东西,X教授没告诉我们的是什么姿势是学术所不能容忍的?我一直在文章中强调抄袭分两个层面,一是无视软件的开源协议(开源也是在版权的框架下的所谓反版权,开源协议本身也是版权协议),二是文章用了大篇幅在把别人做的东西当成自己做的来介绍(像ppiPre把GOSemSim实现的东西当成自己的原创实现来介绍。X教授把抄了别人的实现当成是各自实现,说是平行工作!偷换得一手好概念)。

X教授的观点无非是读书人的事情不能算偷,他的文章一直是用了别人的软件、用了别人的代码,而一直回避我强调的写文章说自己实现了别人的代码!你敢这么写,所谓的正确姿势(引用/致谢),全部都要失灵的,我不知道X教授是读博士期间,中科大没上过科学伦理课呢,还是去华中科技大学当教授,岗前培训没到位,似乎对「抄袭」的定义一无所知。X教授的文章也一直回避、无视这个最重要的点,我们永远无法唤醒一个装睡的人,我也不打算写文去掐了,反正X教授都是自说自话,持续在输出自己的正确姿势而已。

有学术修养的人,看完系列文章+X教授的回应,都应该有自己的评价。