biobabble公众号2019每月精选
1月
很多人在网络上寻找帮忙而得不到帮助,通常是自己的问题,不要做伸手党,没人欠你一个答案。
2月
我给pheatmap
加了个输出为pheatmap
对象的功能,再给ggplotify
写个方法,让pheatmap
的输出转为ggplot
,这样就可以不需要grid的知识也可以愉快地进行拼图了。
PS: 之前的版本,也是可以拼的,但你需要一点grid的知识。
3月
这一篇介绍了一个灌水的姿势,是个R包,想发表应该都可以吧 =,=
4月
这一篇真的厉害了,年度阅读量最高!我们平时画图,能把数据呈现出来就行,至于细节嘛,很多人都是用illustrator,但我们在R里,可以直接导出为ppt,矢量图,任何细节都可以用ppt修改了!
5月
其实本公众号的读者都应该知道clusterProfiler
是个通用的工具,这一篇只不过是用了CellMarker的数据进行演示而已。使用clusterProfiler
你经常可以问有没有在XXX中富集这样的问题。而XXX可以是任意的东西 :)
6月
某书作者的表演功力可能比画图功力要好。竟然这篇会成为月度最佳!
7月
用简单的两行代码,告诉大家,在R里处理图片是多么爽。
8月
这一个故事告诉我们,会写R包多么重要,当然技能其实也是次要的,最重要的还是走不走心。
9月
R语言世界排行,当然这个排行是很水的,只不过是github repo被star的数目进行排行而已,不代表真实水平。
10月
这一篇分享了一个简历模板,纯Rmarkdown,而你只需要改一个csv文档,重新编译就可以更新简历。门面很重要,当然简历简历,最重要的还是要有「历」。
11月
cowplot
是我们拼图的利器,但patchwork
出来好多新特性,让人无法不移情别恋。
迷恋新欢,又难舍旧爱,真纠结。
12月
生信媛的PLMM写的代码,利用clusterProfiler
去爬KEGG数据,然后打包成KEGG.db
,实现KEGG分析的本地化。我呢顺手把这脚本打包成R包,让R包生成R包。
这一篇有后续,支持了多物种,《多物种批量下载KEGG数据并做成KEGG.db包》。