IBW2011

开完了IBW这个会，感觉比较面向学生，会议前的龙星课程，倒是不错，我就冲着它的题目过去的，我想听的是概率图模型和系统生物学，结果只有最后一天，早上讲了点bayesian network，下午讲了会GSEA，BN讲的只是基本的概念，GSEA讲的内容还不到位，只讲到fisher’s test做enrichment analysis，并没有讲如何把表达量通过某些方法把它转化为统计量，再进行enrichment analysis，没有考虑表达量，是不叫GSEA的，提出GSEA的那篇PNAS文章，讲的就是expression+prior knowledge (gene set)。

几天的时间，基本上是讲Hidden Markov Model用于序列比对，Prof Tang以前是在Waterman那里做post-doc，估计也是搞了很长时间的序列。我对这块兴趣不大。

会议两天，除了几个speaker之外，似乎都是学生，会议本身也比较面向学生，第一天晚上，还搞座谈，让学生去提问，不过大多数是研一，博一的新生，从别的背景转入生信，很多人都问到，要怎么去学另一个学科的东西，要怎么去选题啥的。扯这些东西，没啥意义。还有个普遍的怨念，搞计算机的，总觉得自己在给生物的打工。

由于大部分的speaker是学计算机出身的，有些可能计算机方面，比较难的东西，在他们看来是理所当然的，忽略这些东西，我觉得是OK的， detail并不重要，关键要讲清楚，如何把一个生物学问题formulate成一个逻辑计算过程，思路是最重要的，可惜的是，大部分把introduction部分讲得太细太慢，学计算机的人总喜欢讲生物，而这些东西，在学生物的看来，都是理所当然的那一部分，就像他们觉得理所当然的计算机的那一部分一样。总在讲最基本的东西，然后就发现时间不够，然后就直接讲结果。

最为重要的问题，如何把生物学问题，formulate为一个计算问题，没人提及。

让我感觉不如去听生物学的会议。

明年不参加这个会了。

PS:41大招待所没有网络，无聊之际，用电脑通过蓝牙连接手机，再通过手机GPRS让电脑上网，很不稳定，太苦逼了。