这个题目可以放好多不正经的图，我在这个公众号里面已经写过太多，比如《邪恶的曲线》和它的3D版本，《3D版邪恶的曲线》，但这里不涉及太多，只用geofacet这个包为例。
微信公众号平台大部分人都是抄来抄去的二手资料，像joyplot这种特别新的东西，就很难看到，我试着搜索了一下，发现只有三篇，都是我写的。
在《你所不知道的，R的N种打开方式》一文中，我介绍了R的N种界面，这里将介绍一个用python写的极其现代化的R命令行界面，rtichoke（之前叫rice）之于R，就像ipython之于python一样。
特性
- 轻量，不需要编译
- 多行编辑，这点很重要啊，长长的命令可以换行后，随便回去编辑前面的指令
- 语法高亮，这可是R命令行所没有的，看起来舒服多了
- 自动补齐，减少输入
- 支持bracketed paste mode，也就是说你copy-paste了有换行符的字符串，不会拷进去就自动执行了
- 支持Windows, macOS 和 Linux
- 支持vi, emacs等编辑模式
- 可以多种高亮模式
最初github上用户（@JustGitting）报告说geom_hilight和geom_cladelabel不能用于unrooted树。详见：https://github.com/GuangchuangYu/ggtree/issues/118
我表示这确实是不行的，然后这就变成了feature request。我继续表示unrooted tree在ggtree中的实现并不好，我只实现了equal angle algorithm，在写注释图层之前，如果我有时间的话，我希望可以先实现更好的layout algorithm。
然后JustGitting表示，他发现python的ETE和R的ape，在无根树的可视化上好像都不太行。问我有什么unrooted的layout algorithm，有没有什么参考文献，或许他可以帮忙实现，因为他觉得ggtree是最成熟的软件。
《听说你有RNAseq数据却不知道怎么跑GSEA》一文有小伙伴问封面的gseaplot能否换颜色，于是我就随手支持了。
最近公众号「生信媛」和「生信宝典」的小伙伴在说ggplot2无法一次性设置所有字体，theme只能设置axis text, title这些，而搞不了geom_text，geom_text必须要手工输入family=XXX来设置，因为不能使用theme来更换，也就是说没办法通过后处理来设定，比较麻烦。
这显然是不对的，后处理必须可以的，一次性满足所有愿望也只是因为没人写个神奇的函数而已。于是我就动手写了个set_font的函数。
假设我们有下图：
library(ggplot2)
d <- data.frame(x=rnorm(10), y=rnorm(10), lab=LETTERS[1:10])
p <- ggplot(d, aes(x, y)) +
geom_text(aes(label=lab, color=lab), size=10) +
geom_text(aes(y, x, label=lab), size=3)
我的公众号biobabble第一篇原创文章《邪恶的曲线》，因为太邪恶，当时只推送给男性关注者，由于不是推送给所有人，所以历史记录是翻不到的，之前有再文字推送一下链接，结果评论区全是差评，我也是蛮囧rz的…
无意中我又翻到了一张2012年2月份画的3D版本，尽管你们要差评，还是想分享一下。代码就在截屏之中，想玩的话，可以照着输入，支持鼠标旋转哦，可以慢慢把玩（太邪恶了）。
