院里使用Microsoft ISA proxy作代理，我用linux，firefox可以通过代理验证，在终端export代理的环境变量也可以用。虽然很多软件不能支持认证，我也懒得理了。由于要用Cytoscape来分析蛋白相互作用网络，这个软件能支持代理却不支持NTLM认证，为了突破这个限制，只能作二级跳了，在本地设一个代理，软件通过这个代理上，而用本机代理负责去连接院内的代理并进行认证。
搜了一下，发现ntlmaps这个包可以用来做认证，这个包是用python写的。
> apt-get install ntlmaps # 安装。
安装完就是修改配置文件/etc/ntlmaps/server.cfg
设定网络监听的端口、父级代理的IP和端口、账号、密码、网域。
有时候心情不好，就会写一些伤感的日记，然后过两天，再拿出来看一下，然后就删了。很经常这样。 其实可以藏起来，绝对超乎一般人的想像。不过我只在本科的时候这样藏过，大叔我不喜欢藏东西。呵呵。。。
拿出来分享一下，不然烂在我肚子里，也是一无用处的。。。
YMZ的事件，告诉大家一个真理，当个电脑小白是很吃亏滴。。学会藏东西是很必要的能力。。
不过我不送修电脑，就是笔记本我也自己拆。。
GE公司codelink芯片(这个破产品已经停产了)上的探针ID，需要转成别的ID，看了一些在线的转换ID工具，都不支持，探针ID基本上都只支持affy的。
想起了bioconductor里的biomaRt，这个包可以检索BioMart数据库，这个数据库里有N多种ID。试了一下，果然没问题。
#加载biomaRt包
library(biomaRt)
#选取数据库
ensembl = useMart("ensembl", dataset = "hsapiens_gene_ensembl")
#获取可供检索的attribute
attributes=listAttributes(mart=ensembl)
#看一下attributes里是否有codelink，得到以下的结果。
attributes[grep("codelink",attributes[,1]), ]
name description
21 codelink Codelink ID
#再搜一下其它我想要的ID
#读进含有codelink ID的文件。
mrna_id <- read.table("mrna_id.txt")
#进行ID映射。
idmap <- getBM(attributes=c("codelink","refseq_dna","external_gene_id",
"embl","hgnc_id","hgnc_symbol"),
filters ="codelink", values=mrna_id[,1],
mart=ensembl,output="list")
用PITA算法做靶标预测的时候，要用到ViennaRNA包做结构的折叠，这个包是被修改过的，原来的包在我机子上是可以装的。但是这个修改过的包编译不通过。很奇怪的错误，不知道怎么改。
好在它有两个版本，64位和32位的。我弄到大型机上去编译32位的，也是出错，不过是命名空间的问题，我改两个头文件就可以通过了。最近又要算。那个大型机最近被搬走了。只能本机上做。
用了好多年linux，现在用windows越来越少了，但是还是得用。没办法，上taobao买个东西，上网银都得用ie，有时候还得用office等其它一些软件。
实验室里有台机子是做文件服务的，装的是windows 2003 server。之前使用rdesktop远程桌面，最近发现配合seamlessrdp可以让rdesktop实现更好的效果，运行windows程序，就像linux中原生程序一样。。
> [下载
> seamlessrdp.zip](http://www.cendio.se/files/thinlinc/seamlessrdp/seamlessrdp.zip)
> 解压丢在C盘。
在linux下运行这样的指令
> rdesktop -A -s "c:\\seamlessrdp/seamlessrdpshell.exe C:\\Program
> Files\\Internet Explorer\\iexplore.exe" ip:3389 -u administrator -p
> password
就可以在linux下运行服务器端的ie了。windows下所有程序都没问题。
