Bioconductor包的标准安装方法是:

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite(pkg_name)

这其实是非常不好的,多年以来,一直没有改进,试想一下,bioconductor的网站如果被人黑了,放一段危险的代码,然后你却傻傻地去source它,真的是画面太美!

Bioconductor终于是想要改变了,往CRAN上扔了一个叫BiocManager的包,以后通过CRAN安装这个包,再通过这个包来安装Bioconductor的包,显得安全多了,也不用大家费辣么多口水说你得先source一段网上的代码,当然这个BiocManager还不成熟,起码还没有在BiocInstaller加载的时候提示大家转而用BiocManager,也没有在Bioconductor的网页上介绍使用它来安装。

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Guangchuang Yu

a senior-in-age-but-not-senior-in-knowledge bioinformatician

Postdoc researcher

Hong Kong