上次推送的《geom_bgimage》，竟然有人问说用ggplot2怎么搞。明明我的例子就是了，虽然用的是ggtree的例子，但与ggplot2何异？
require(ggplot2)
require(ggimage)
d = data.frame(x=LETTERS[1:3], y = 1:3)
d$y2 = rev(cumsum(rev(d$y)))
p = ggplot(d, aes(x=1, y, fill=x)) + geom_col(color='white') +
geom_bgimage("img/blackboard.jpg") + theme_void() +
coord_polar("y") + theme(legend.position='none') +
geom_text(aes(y = y2 - y/2, label=x),family='xkcd', size=8) +
xlim(-1, NA) + scale_fill_viridis_d()
《画图给点分组?》这一篇文章中给出了方法，画出两层分组的点图，一层分组是按照离散型变量在x轴上分组，第二层是每一个分组里，再来一个离散型变量再分一次。非常感谢读者们的反馈，原来这第二层分组在ggplot2中是有内置的实现方式的，那就是position_jitterdodge。
有一个叫CellMarker的数据库，专门收录组织和细胞的基因标记物，收录还比较全，而且是手工校对的（可怜一下干这种脏活的研究生三秒钟）。
By manually curating over 100 000 published papers, 4124 entries including the cell marker information, tissue type, cell type, cancer information and source, were recorded. At last, 13 605 cell markers of 467 cell types in 158 human tissues/sub-tissues and 9148 cell makers of 389 cell types in 81 mouse tissues/sub-tissues were collected and deposited in CellMarker.
群里大家给出各种解法，但似乎避开了dplyr之后，大家还是会用到plyr或者purrr，没人给出我讲的apply套split的纯base R的解法。
套两重for循环，会让人容易理解一点，而且代码也非常简单，但效率不行，用apply的话，处理各种list，特别如果要list套list，很多人就比较懵逼，需要借助于plyr或purrr，甚至还有人的解法虽然不用dplyr的group_by套summarise，但用了dplyr其它的函数。tidyverse真的太好用，对低端R用户照顾得太好，大家都被惯坏了，但想一下，以前的人真的就不用活了吗？
《潮博沙龙》系受到潮博群里大家的邀请，应邀去普及一下生信以及介绍自己的一些经历。
中国R语言大会，我到目前为止，只参加过2016年那一次，也就是第9届，那也是首次有Bioconductor分会，并且还邀请了bioconductor的老大martin morgan，我当时也是受邀请去参会的，虽然会议在人民大学举行，虽然主会场和其它分会场都是讲中文，但bioconductor分会场是要求讲英文的。因为主讲人一半是歪果仁，一半是中国人，而3个中国人之中又有两个是美帝来的，只有我一土鳖。本来邀请人跟我提了一下ChIPseeker，暗示可以讲这个包，但我强行去讲ggtree，然后会后，很多听众问我clusterProfiler的问题，也是挺尬聊的。
当年我准备考博的时候，健康院某PI（本来的意向导师）找我帮他在iMac上安装盗版的Papers（文献管理器）和Illustrator（PS的兄弟），安装后，跟我说：“我们做科研的，最重要的软件就是Papers和Illustrator。”，当然后来感觉挺坑我，就放弃了。
这么多年过去了，至今这两个软件我都没用过！我画图，追求的是全部由代码产生，至今还没有修图的需求，也就没有试过Illustrator了。
Illustrator必须有些门槛，而且关键是Adobe绑死在PDF上，实际上如果80%的问题都可以用PowerPoint解决，剩下那20%，反正也不常用。而PowerPoint的优点是没有门槛，傻瓜式操作，像我这种怀疑自己智商的人，都会用啊！
要是R画的图，能够在PowerPoint里面编辑就好了！
要是R画的图，能够在PowerPoint里面编辑就好了！
要是R画的图，能够在PowerPoint里面编辑就好了！
