PubMed没有停更

在一篇文章《pubmed停更?和你没半毛钱关系!你们是想放假想疯了吧?》我就解读了所谓的停更,根本不碍事,然后又分析了事情只是被自媒体拿来博眼球而已,真正受影响的NCBI数据库没人说,而PubMed停更的可能性不大。

Because of a lapse in government funding, the information on this website may not be up to date, transactions submitted via the website may not be processed, and the agency may not be able to respond to inquiries until appropriations are enacted.

这个消息,很多人上pubmed看到,就打鸡血了,哟哟哟,号外号外大新闻,真的有过过脑子吗?

transactions submitted via the website may not be processed

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PubMed停更?

今天学术圈刷屏的是美国政府关门,pubmed停更,有些标题党说成了美国政府破产,又说得好像中国人的科研也要跟着放假似的,还一堆人疯传,似乎暗示着pubmed也关门,而且没有pubmed会死一样。所以我感觉有必要普及一下姿势,毕竟吃瓜的人群基数太大。

Holy shit what a fucking disaster, pubmed is such an amazing resource, unbelievable the US would let it waste away. What an embarrassment of a country.

气愤归气愤,但标题党甚至于跑偏了就不可取了。无非只是停更,也就是说文章该发的照样发,只是暂时不会被收录进pubmed而已,也就是说pubmed照常用,只不过搜不到最新的文献,如果说这样就可以去放大假了,那么似乎如果不停更,你看多了几篇新文献,就能够发paper,迎娶白富美了?而看少了这最新的文献,就秒变科研屌丝,可以回家睡大觉了?

The website continues to work. The shutdown will be over in a few days and everything will go back to normal. You can also use Google Scholar, Web of Science, and Scopus.

事实上,pubmed只是一个搜文献的数据库,它停更,文章照发,而大家可以通过别的途径去获得,如果你只有这一条途径,那么你做科研也确实少了点B数。上面提到的google scholar很多人可能上不去(梯子在这里),而Scopus是要收费的。然后途径是很多的,

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在很久很久以前,当我还在用perl的时候,有一个TGen-EUtils的perl模块,可以去爬PubMed,我喜欢用它来画所谓的pubmed趋势,比如说我在2012年的时候,就画了各个组学技术的pubmed趋势,通过每一年的文章发表量来看某个技术到底火不火,走势怎么样。

当年microarray还特别猛,但显然可以看到二代测序必须要火,也可以看到proteomics在吹了几年牛B之后,有回落的趋势。

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Guangchuang Yu

Bioinformatics Professor @ SMU

Bioinformatics Professor

Guangzhou