we’re talking about people who already are skating on the ethical edge (as scientists, we should always respond to serious criticism; if we don’t, that’s bordering on ethical violation already) – Andrew Gelman对此事的评论

我原以为邓岳是个学生,我的本意是要给他一个教训,制止这种行为,我不出来给他这个教训,早晚他也会为自己的投机付出代价,而且如果以后出现多次抄袭,直接会导致无法继续在学术界生存。后来我发现他还是个讲师,我觉得更不应该了,编辑部必须要对这件事做出处罚。这就是我的本意,让邓岳认识到错误,并为此付出应有的代价。

搞得我像祥林嫂一样到处找人说

然而编辑一直不做为,就逼得我只能借助于舆论,我本无意于去网上传播这件事,我写的博客,都是针对编辑部,最后我对编辑提议的处理方式表达不满之后,编辑就消失了,再也不回应邮件。我只能再写博客,再发动舆论,联系之前高调出来说撤稿了43篇文章的那些编辑,推特上也骚扰他们。微博上也AT西电官方微博,求转发之类的。虽然我没有想去闹大事情(尼马我也不想花时间扯这些蛋啊),但BMC就是逼着我跟他斗,而事情闹越大,对抄袭的人来说,越是不利,搞不好学术界就不用混了。谁都不傻,所以终于坐不住给我写信。

其中说到“1、2月份和您邮件沟通”,只是说了按照CRAN policy改了代码,并把我列为作者,而后面我回应把我名字从软件包作者中去掉而已。

他的邮件大概讲了和编辑并无操作,软件包已经按要求更新,犯错是源自于无知。

这事最后怎么处理?

由于邓岳并未认识到错误所在,我回信给他上了一课,同时也警告他闹大了对他不利:

他自己提出来要去撤稿:

我表示并无异议:

还给我发了一个撤稿声明:

事情就这么愉快地结束了?

我本来也是这样想,也没有再跟进这个事情,如果真的是撤稿了,第一给了抄袭一个教训,科研没有这样的捷径!第二虽说是我网上造势才有这样的结果,但也算是掐赢了BMC,最后没有让编辑给操作了。然而拿衣服(naive)啊年轻人!

又过了半年,我偶然发现没有撤稿啊!恶意抄袭,被抄袭者举报并要求撤稿,抄袭者承认并要求撤稿,然后却没有撤稿?!这是什么鬼?!我不知道抄袭者和主编是如何沟通的!他们自己处理了这个事情,期间我并未收到任何来自这两方的邮件。

让我们来划重点,看这事有多扯

主编都躲起来

期刊主编做出决定即使不用和我沟通,告知总要吧?不要说之前主编说可以出个correction就是告知了,当时是询问我,而我提出异议,之后他们就回避,从不回复邮件。再者我联系其他主编,有承诺要去查这个事情的,最后都没有回音。

抄袭者两面三刀

邓岳都起草了撤稿声明,并发给我看了,你们在沟通之后,不这么干了,也得和我沟通一下吧?

被抄袭者已哭晕在厕所里

如果真的是发声明,我认为我的proofread是必须的。抄袭者写声明,被抄袭者把个关,很合理吧?不然闹出个为声明写声明,那就奇闻了,绝对上头条。

鼓励抄袭?

不抄白不抄,没被发现,当然没事。被发现了,哦,对不起我忘记致谢引用了,发个声明,还是没事。文章照样用,该评职称照评,该拿课题照拿。

到底是怎么声明的?

声明不长,全文录入:

https://bmcsystbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12918-015-0196-5

The authors wish to acknowledge that the software package associated with our Research Article [1], under the name ‘ppiPre’, re-used software code for some of its functions from an existing software package, GOSemSim [2], without proper attribution and in breach of the software’s licencing terms. Additionally we neglected to cite the article by Yu et al. [3] describing the GoSemSim software.

The software code from GoSemSim [2] is used in the implementation of two GO semantic similarity measures, TCSS and IntelliGO. ppiPre additionally implements a KEGG-based similarity measure and three topological similarity measures, and integrates features with a support vector machine.

We have now updated our software package such that it is licensed under a compatible GPL version 2 licence, and revised the package to give the appropriate attribution.

We apologize for any inconvenience this oversight may have caused.

注意措辞,地都给洗白了,作者只是没有按照licence给出一定attribution的情况下,重用了一些代码,而这些代码只是拿来实现GO语义相似性度量(又变成有种自己实现的感觉了)。


如果不是BMC一直不做为,我当年就不会在网上搞事。如果不是作者两面三刀,这事也就不会还在我心里没过去。然而我做的也是徒劳!必须是徒劳,就跟造谣动动嘴,避谣跑断腿一样,抄袭者毫发未损,而我就像祥林嫂,逢人便说“我真傻,真的。。。”。

这个事情,最恶的还是BMC编辑部,这背后必须是有人在把持,BMC撤稿43篇文章时说那些文章是’manipulating review process’,然而就我经历的这次事情,这分明是’mainipulating editorial board’,这难道就是科研圈现实?

ppiPre是发表在ISB 2012会议上的,这个会议明显是和BMC Systems Biology合作的,会议文章发表在BMC Systems Biology专刊上,而ppiPre的通讯作者是会议的Program Chairs,而某些BMC Systems Biology的编委是General Chairs,我们不防空穴来风地猜测一下,画面太美,我不敢看!

PS: 讽刺的是抄袭者的公众号叫「老师老实说」