像这样的通路图，基本上都是手工画的，也有几个软件可以做这事，但都不流行，毕竟也没啥，无非是素材，所以多半还是素材+熟悉的软件，比如有illustrator、fireworks以及最受欢迎的powerpoint。像illustrator很多人已经很熟，或者powerpoint绝对够傻瓜操作，我们需要的只是素材，自制素材也是可以的，但费时且有时候还不够好看。很多人还在费力收集网上可以下载到的各种素材，很多素材覆盖面不够广，而不同来源的素材混搭有时候会有种画风不对的感觉。
Sci-Hub是居家旅行学术必备的神器，毕竟穷人比较多，而出版社太黑心。但Sci-Hub有一个问题是镜像站经常挂，我之前给出了一个比较可能不会挂的链接，《再不用担心打不开sci-hub了》，那就是洋葱链接。当然洋葱链接比较慢，我们还是更倾向于使用普通的链接，所以我又收集了《2018最新可用的sci-hub镜像+桌面版程序》，当然这些链接随着时间的推移，有些可能也会挂。
任何时候，我们都应该有多手准备，所以我一直都有备选方案，虽然不如sci-hub，虽然现在sci-hub还能用的情况下首先还是sci-hub，但收藏一两个备选工具是必要的，它让你在面前变化的时候可以淡定。《sci-hub如果挂了，你还有神器下文献吗？》这篇文章介绍的神器即使你现在不用，也该收藏着。
在一篇文章《pubmed停更？和你没半毛钱关系！你们是想放假想疯了吧？》我就解读了所谓的停更，根本不碍事，然后又分析了事情只是被自媒体拿来博眼球而已，真正受影响的NCBI数据库没人说，而PubMed停更的可能性不大。
Because of a lapse in government funding, the information on this website may not be up to date, transactions submitted via the website may not be processed, and the agency may not be able to respond to inquiries until appropriations are enacted.
这个消息，很多人上pubmed看到，就打鸡血了，哟哟哟，号外号外大新闻，真的有过过脑子吗？
transactions submitted via the website may not be processed
今天学术圈刷屏的是美国政府关门，pubmed停更，有些标题党说成了美国政府破产，又说得好像中国人的科研也要跟着放假似的，还一堆人疯传，似乎暗示着pubmed也关门，而且没有pubmed会死一样。所以我感觉有必要普及一下姿势，毕竟吃瓜的人群基数太大。
Holy shit what a fucking disaster, pubmed is such an amazing resource, unbelievable the US would let it waste away. What an embarrassment of a country.
气愤归气愤，但标题党甚至于跑偏了就不可取了。无非只是停更，也就是说文章该发的照样发，只是暂时不会被收录进pubmed而已，也就是说pubmed照常用，只不过搜不到最新的文献，如果说这样就可以去放大假了，那么似乎如果不停更，你看多了几篇新文献，就能够发paper，迎娶白富美了？而看少了这最新的文献，就秒变科研屌丝，可以回家睡大觉了？
The website continues to work. The shutdown will be over in a few days and everything will go back to normal. You can also use Google Scholar, Web of Science, and Scopus.
事实上，pubmed只是一个搜文献的数据库，它停更，文章照发，而大家可以通过别的途径去获得，如果你只有这一条途径，那么你做科研也确实少了点B数。上面提到的google scholar很多人可能上不去（梯子在这里），而Scopus是要收费的。然后途径是很多的，
之前的《如何获取文献》介绍了方方面面，不单单是下载文献，而对于下载文献，scihub必须是首选，虽然我们有备选方案《sci-hub如果挂了，你还有神器下文献吗？》，但总是没scihub爽，之前介绍了用洋葱链接，《再不用担心打不开sci-hub了 听说你也在读文献》，在写这篇文章的时候，我还测试了一下，现在依然可用！
目前挂掉的scihub镜像已经很多，导致很多人认为scihub没法用了，其实还有很多的镜像是可以用的，当然能用的，以后也可能会挂，但新的镜像我相信还是会不断出现的，大家且行且珍惜吧。
最近似乎就oncotarget是否要被SCI踢出来这事情，真真假假的报道挺多。以我的观点来看，它被踢是正常的；它不被踢也迟早要被踢！就像当年它的影响因子还在7点多的时候，我就预言oncotarget药丸一样，结果就直接掉到5点多，然后关于神刊的报道就开始多了起来。
话说我在某高校工作的时候，有一个同事，他跳槽了！跳槽前各种暗渡陈仓，压着文章不发表，蓄谋已久的事情，然后就在跳槽的当年，可能为了掩饰，当年还继续招生，结果当然坑惨了那一届的学生，当然前面两三届也惨，因为数据压着不发表。
虽然离职前和旧单位签了协议，数据是在旧单位做的，发表文章旧单位必须是通讯作者，仅此而已，反正都是他通讯，挂两单位而已嘛，这在学术界再正常不过。此人去了新单位之后，本来该发文章了，原来的学生干了几年，也该给人一个authorship了，然而他把新单位的领导放在了第一作者，自己当了通讯，原来的学生嘛，见鬼去了，其他作者多半是他的新同事/学生。当然通讯也没挂原单位，对于没有社会契约精神的人来说，协议就是一张废纸。
对于生信狗，天天黑白命令行，实验室的同事，经常对着我的Emacs说，这么小的字体你看得清吗？我只能无奈地回答，因为我要一个屏幕显示一整个函数。我自己平时写代码也很注意这一点，函数尽量小，太长就要考虑切分成几个函数，我说自己是脑容量不够，写不了长函数。我希望如果有人看我代码，他/她可以看得舒服点，虽然写的不见得好，但起码一个函数，你一个屏幕是装得下的。岁月留给我们的，是越来越厚的镜片！然而最近有一款神器，让我们在命令行里，可以高亮显示生物学常见的数据格式，包括SAM, VCF, GTF, PDB和FASTA。这款神器叫bioSyntax (http://bioSyntax.org) ，看着舒服多了，而且逼格十足，如果大家序列比对看多了，其实都会依赖于看颜色，黑白字体情况下，你很难去区分ATCG，即使有明显的pattern，你也很难看出来。
