虐狗节来看一下这个裤衩都不要的故事
Scientific Report上有一篇文章是抄袭的，然而杂志最终决定不撤稿，而被抄的人是Johns Hopkins的，于是jh的人全都要离开Scientific Report的编委。我也被人抄了不撤稿，然而我人微言轻，不单被编辑部欺负，还要被我们国内生信界的网红欺负。
SR与jh的事情，我和BMC的故事，是相似的，我们可以想像这样的学术界惨剧比想像中的要多。学术圈，真是有时候得呵呵哒。
我的这个故事，分为4集连播：
这一集摆出抄袭证明，铁证如山，并且预告了是期刊的学术不端行为。他们不做为，他们保护抄袭。
第二集，直播我与编辑的往来信件，这种事到底有多扯。扯鸡巴扯毛线都没这么扯的。编辑玩消失，不回应，不作为，就当没事发生。最后跟我说「呀，道个谦，也是符合期刊的政策的」，我操政策你妈逼啊！从此编辑永远地消失了。
第三集，算是个插播，除了抄袭我的，那位抄袭者还抄袭了别人的，靠两篇抄袭的文章从讲师混到副教授。而且我还无意中发现了一个抄袭链。某人抄了一篇文章去发表，另一个人又来抄还他妈也发表了。
第四集，最后的结局，在编辑说「呀，道个谦，也是符合期刊的政策的」之后，我再也没收到邮件，期间抄袭者还联系我说要去撤稿，最后在抄袭者两面三刀，编辑黑箱操作，我完全未知情之下，洗地文出来说，说不好意思啊，我们忘记引用了，完事。
在Scientific Report这个事情，当期刊决定不撤稿时，Ted Dawson教授做为编委，他告诉大家说：
I resigned as soon as I learned that Scientific Reports elected not to retract the paper.
It seems Scientific Reports has a unique publication policy — “If you are caught plagiarizing someone else’s work in Scientific Reports, all you need to do is apologize and publish a corrigendum.” I don’t think this is something the community should support or we are condoning this behavior.
这何尝不也是BMC Systems Biology的政策，被发现了，道个谦了事！我不是一个人在战斗！
这个事情我从头到尾被期刊和抄袭者欺负了一遍！简直是拉屎拉尿！然而我们国内还有生信界网红X教授，看我还是个学生，觉得不过瘾，也要来踩两脚！在科学网上发表了文章《BMC没有学术不端》。他说什么呢，只不过是忘记引用了。最近SR这个事情真的是打了X教授的脸。
SR杂志决定不撤稿的理由，就写了有引用。
Beer’s work (including the PLOS Computational Biology paper) was cited and discussed multiple times in the original paper in the appropriate context.
因为不撤这篇抄袭文章，已经有19个编辑退出不干了。你把别人的东西当成自己的来写，必须是抄袭，引不引都是抄袭。
然后X教授还以大佬的身份教训了小弟，说我做为个学生不该联系编辑，应该让通讯作者点到为止，差不多就可以了。所以我写了一篇文章回应，祝大佬们和和美美做科研。
然后X教授又写了一篇，《如何姿势正确的使用他人代码？》，他说只要有一点自己的东西，就不算抄袭。
GOSemSim做的是GO分析，ppiPre做的是相互作用预测，即使这两个代码相似度在99.9999999999%，那ppiPre也必然有自己独到的东西，不然如何能预测蛋白质的相互作用？所以抄袭是不存在的。
真的是和Scientific Report一样的价值观啊。下面是Scientific Report不撤稿声明写的：
We believe that the paper makes an original contribution to the literature in that it takes existing methodology and applies it to a new question or issue
当然19个编委选择离去，本身已经是个很好的回应了，有人还表示从此不愿意为他们审稿：
I will no longer review for your journal, and I will encourage others not to as well.
这让我想起来我也给BMC Bioinformatics审过稿，并且在杂志的感谢列表里还能查到：
我以后也不再为BMC系列的文章审稿，你妹啊！
X教授这篇《如何姿势正确的使用他人代码？》真的是吃相太难看，身为教授，写文章现身说法说如何去打擦边球，拿别人的东西来发自己的文章。厉害了，在下佩服！连最后的遮羞布都不要了。于是我回应一篇：
最后强调一点，我并不反对别人抄我的代码，但要有acknowledgement，然后你不能试图抹除作者的痕迹。在学术界你更加不能把别人的东西当成自己的来发表文章。
