像这样的通路图,基本上都是手工画的,也有几个软件可以做这事,但都不流行,毕竟也没啥,无非是素材,所以多半还是素材+熟悉的软件,比如有illustrator、fireworks以及最受欢迎的powerpoint。像illustrator很多人已经很熟,或者powerpoint绝对够傻瓜操作,我们需要的只是素材,自制素材也是可以的,但费时且有时候还不够好看。很多人还在费力收集网上可以下载到的各种素材,很多素材覆盖面不够广,而不同来源的素材混搭有时候会有种画风不对的感觉。

今天给大家介绍一个reactome通路所用的素材,reactome目前可能是最大的通路注释库了,比KEGG的注释要全面很多,毕竟KEGG只是代谢通路比较强而已,而reactome的覆盖面要广得多,用reactome进行富集分析可以用我的ReactomePA包,和clusterProfiler用法一致,做图函数共用,你值得一试哦。

reactome的这套素材,去年在一次会议上发布,当时只有300多个图。

现在已经有接近900个图了,包含了我们画通路图所需要的各种素材,分门别类,我们可以在熟悉的软件比如illustrator、powerpoint中使用这些素材来画通路图。

比如细胞类型

细胞元件

转运/通道蛋白

甚至于连人体组织都有:

下载地址请猛击: https://reactome.org/icon-lib.