抄袭的是西安电子科技大学的讲师,靠着两三篇抄袭的文章,已经是副教授了。

这种抄袭的事情就应该暴光,这个事件中,更可恶的是BMC,BMC这种保护抄袭的行为更应该暴光,大家不要再给BMC送钱了,还不如发PLoS One。

公众号有人评论说:

这竟然也被捕捉到了,确实他在2012年的时候,就在copy我的代码,然后打R包的时候,还请教了我:

抄了我的代码,之后厚颜无耻地感谢我说学了很多东西,他的良心真的不会痛吗?

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编辑部的恶才是最大的恶!

大家是否还记得2015年BioMed Central高调地撤稿了43篇文章,站在道德制高点对审稿过程进行了指责,吐了学术不端一脸口水?

就在这个时候,我写信去BMC Systems Biology告别人抄袭,编辑部信誓旦旦,他们对这种事情是非常认真对待的,然而接下来的剧情却反转了,在我证据甩他们一脸的时候,他们拖着不处理,拖多久呢,超过1年!一直在给抄袭者洗地,最好在没有告知我的情况下,静悄悄地出了个所谓的erratum

erratum是什么?字典里这样写:

erratum |ɛˈrɑːtəm|
noun (pl.errata |ɛˈrɑːtə| )
an error in printing or writing.

我告的是抄袭,plagiarism:

plagiarism |ˈpleɪdʒərɪz(ə)m|
noun [ mass noun ]
the practice of taking someone else's work or ideas and passing them off as one's own. 

结果plagiarism到了编辑部那里变成了erratum.

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在《如何获取文献》一文中,我介绍了获取文献的方方面面,从搜索、文献管理、订阅、个性人推荐到下载。本文再继续说说文献下载神器。

Sci-hub无疑现在是很多苦逼科研工作者所依赖的最大神器,然而最近败诉给爱思唯尔出版社,赔1500万美元,这点钱显然是不能够搞垮sci-hub的,但是败诉本身给大家带来的信号对sci-hub的影响会更大,必须更大!美国化学学会几天前也发起了对Sci-Hub的诉讼!sci-hub很有可能在败诉的影响下,被群起而攻之,最终被各大出版社给掐死。

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以下这些情况是否在你的科研生活中出现,并给你一定的困扰: 你想投文章,却不知道该投什么杂志? 你在写文章中,想找一篇相关的文章来引用? 如果你是Editor,想为文章找审稿人? 这些问题特别是第1点一定给做科研的人带来了困扰,当然首先你得有manuscript(说多了都是泪)。 这时候我们需要一款神器,JANE:Journal/Author Name Estimator, http://jane.biosemantics.org/。你可以用关键字、标题或摘要来搜索,可以搜索作者、文章和期刊。搜索结果按照相似度给出。 文章投什么杂志 拿自己的摘要去搜期刊,可以找到相似的工作都发表在什么杂志上,这对于我该投什么杂志有参考和指导意义。 找相关文章来引用 这时候把要引用的内容拿来搜文章,相关的文章就搜出来了。 找审稿人 拿别人投稿的摘要来搜作者,轻而易举就找到了相关发表类似工作的作者,联系一下是否愿意审稿,方向性很强,节省了大家的时间,也容易找到专业人士来审。 实例 最后用我DOSE的文章摘要做为实例,copy-paste到搜索框,这里我点击搜期刊: 我自己的文章就搜出来了,然后还有一些相关的文章,也是发表在Bioinformatics上,第二个相似度高的期刊是BMC Bioinformatics,再没有理由说不知道文章该投哪里了吧?! 最后的最后,只想问一句,能来个共一吗?

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viziometric

收到了Viziometric的邮件:

说要我给自己的一篇文章选一张图做为代表,我顺手点开,没想到这是一款神器啊!这是由University of Washington做Computer Vision的研究生做的一个学术图片搜索引擎,去年被Economist和MIT Technology报道过。

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OSX版BioEdit

BioEdit是一个Windows的程序,但在这里我要说的是苹果版!

BioEdit有很多的功能,当然基本上我是不会用的,然而其核心的功能,编辑序列比对,是没法回避的!因为根本找不到可以与之匹敌的软件!

神马!序列比对不都是clustalw, muscle, mafft这些软件生成完事吗?怎么还要编辑?!我只能说,年轻人,拿衣服啊。

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通常做blast,我都是输出asn格式,然后用blast_formatter抽出需要的信息写成表格格式。

序列的description行当然不会有重复,但是ID (第一个空白前面的字符)是有重复的,从qseqid来看,就分不清是那个序列,于是准备让blast_formatter把query title(整个description line)给输出来,结果仔细阅读了blastn -help发现不支持呀不支持!然而它支持stitle和salltitle,也就是subject的可以,但query的不行,这绝逼是一个大坑!_| ̄|○

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Guangchuang Yu

a senior-in-age-but-not-senior-in-knowledge bioinformatician

Postdoc researcher

Hong Kong