几年前自己总结出来的，就两个字“标记”，可以概括大部分的生物学实验的基本原理。 这个方法，中国人民老早就在用了，八仙张果老成仙那段，张果老吃的人参精，就是因为被弄了根绣花针才被捉的，还有蓝色的葫芦娃，会隐身，小时候看的，记不清怎么被捉的，肯定也是被标记了。。
生物学实验都是些看不见，摸不着的东西，所以基本上都是使用这个方法，看不见的，我们拿看的见的去标记它，测不着的或者不好测的，拿可以测容易测的去标记它。很多的实验手段，其实最初都是很简单的，为了提高灵敏度和精度，不断改进，越来越烦琐，抑或者出现了一些分支。通常这时候，最初那个简单的，最根本的东西就被人所忘记。看到的尽是表面上的细节。至少现在的书太二了，本来基本上一样的实验，阐述原理的时候被描成了两样的东西。
同位素标记，荧光标记自不用说。芯片实验也是标记，array上的spot序列是已知的，它会跟什么基因杂交，也是已知的。我们并不知道会有什么基因表达，但是当抽提的东西，跟某个spot有杂交信号的时候，我们就知道某个基因有表达。这就是标记。还有我们需要知道表达的量，这个依然不好测。同样也是使用标记，用cy3或cy5来标记，通过检测荧光的强度，就知道了表达的量。
所有的杂交实验都是标记，southern blot, northern blot, western blot都是。不管是核酸还是蛋白，不管它是用什么介质。都是用一个已知的，去标记一个未知的。通过测已知来估计未知的东西。
跑胶的时候，拿去紫外灯光下看。同样也是因为标记。DNA我们是看不到的，但是在DNA下嵌入了EB，可以在紫外灯光下看到EB，所以我们也就看到DNA。
所有的切片，都是在做标记，不管是用于光镜还是电镜，其实电镜本身和光镜是没本质区别的，因为可见光的波长范围很有限，电子也是一种波，成像原理是一样的，只是我们不能直接看到而已。使用电子是为了突破可见光的局限而已，使用光镜需要对细胞进行染色，使用电镜也是一样，不过染的不是染料，而是金属。
测蛋白，用考马斯亮蓝染。在280nm有吸收，那是因为苯环的共轭电子对。虽然不是标记上去的，但也可以这么想，反正是测一个我们已知的东西，来估计未知道的东西。
DNA测序，给四种碱基标上不同的荧光。
还记得脂肪代谢是怎么被揭开的吗？使用接了苯环的脂肪酸喂马，收集马尿去检验，因为马不能代谢苯环。所以拿苯环去标记脂肪酸。
还有那个DNA还是蛋白是遗传物质的实验，肺炎双球菌实验。分别用S和P的同位素标记蛋白和DNA。
还有一些看似不是标记的，其实也是标记，比如酵母双杂交，因为转录因子都有一个DNA-binding domain和一个RNA-binding domain，我们并不能直接检测到蛋白X和Y是否有相互作用，但我们可以表达溶合蛋白DBD-X和RBD-Y，如果XY有相互用用的话DBD和RBD就会在一起，就是一个有功能的转录因子，就可以转录报告基因，检测到报告基因，就表明了XY有相互作用，这就是标记，拿DBD和RBD去标记X和Y，通过DBD和RBD的行为去估计X和Y的行为。
DNA重组也使用标记，我们无法直接检测到是否重组了，是否在需要的位点重组了，所以使用了报告基因来做标记，检测到报告基因了，表明重组了，使用抗药基因，在加了药物的培养基上筛选，活下来的表明重组正确。当然有假阳性。抗药基因也是“标记”。
基本上绝大多数的实验原理，最根本的一个想法，就是使用一个已知的，或者容易检测的，去标记一个未知的，或是难以检测的。
实验的手段太多了，很多人搞不清原理。做实验的人，通常就是照着实验手册，一步一步在加东西而已。只要稍微思考一个，很多东西，其实不用记。细节的东西不需要记，需要的时候查就行了，当是基本的原理还是需要理解的。不然白学了。
很多人觉得生化就是一堆描述性的实验结果。其实很多东西也是不需要记的。举个例子，比如说DNA转录的时候，组蛋白会被乙酰化，这个细节很多人就是死记下来的，当然国内的书太二了，很多书没说乙酰化的位点是Arg和Lys，不过告诉这个事实，很多人还是死记下来。其实想一下，理解了，就不用记。为什么是这两个AA，而不是其它的？组蛋白之所以带正电就是因为富含这两个AA，这两个AA都有-NH，带正电，正是由于乙酰化了这两个位点，屏蔽了正电，DNA是带负电的，所以乙酰化之后正负电引力变小了，结构就松散了。有利于转录。这个东西就变得理所当然一样，根本不需要记。
今天看了一篇文章Can a biologist fix a radio?, 作者讲了个悖论，越多事实的积累，对于所研究的process理解的越少。
这确实是现在的现实。许多的科研结果，其实就是便这个本来很混乱的世界更加混乱。文中还讲到了科研的淘金热。昨天我正好看到了science上的文章说impact factor fever。当科研成为一种职业，真正对科学有热情的scientist并不多，更多的人仅仅是为了拿grant，要拿grant，就要发高分的文章，哪里好发文章，那里就有一堆人在抢。顺带一下，大家都说生物是火坑，其实学科在发展的初期，对于科研人员来说还是有利的。如果说工作的话，确实是火坑，其实生物是个暴利行业，如果你身在火海中，那是因为你处于生物链的最底层。
You don’t have to be a genius to understand the work of the Nobel Laureates. These games and simulations, based on Nobel Prize-awarded achievements, will teach and inspire you while you’re having FUN! Students, teachers and non-professionals of all ages will enjoy testing and building their knowledge in physics, chemistry, physiology or medicine, literature, peace and economics. So, go ahead, Explore and Learn!
迅雷的url很恶心，硬是把你绑死在它的流氓软件上，今天试了一个用base64解码，果然用这个伎俩来欺骗用户。在原始的url前面和后面各加两个字符，然后用base64编码。写了下面一段script来还原出原始的url，这样随便用那个下载工具都可以用了。
找了一个叫博客备份软件的小工具,备份了新浪和ChinaUnix上的blog,导出为RSS 2.0, sina的blog导出没问题,但是cu的blog导出后,文不对题.狂汗啊… 但是生成的xml文件导入到wordpress里不成功.需要改一下才行.
从导出的xml文件里,把<description><![CDATA[替换成<content:encoded><![CDATA[
相应地把]]></description>替换成]]></content:encoded>
powerbook笔记本装Mac OSX 10.2，我嫌太慢了，就装了gentoo，所有的东西都是从软件编译，费了很长的时间，CPU太慢了。原来的硬盘只有10G，后来我又换了60G的硬盘，就是现在要备份数据的硬盘了。换硬盘的时候，没有换系统，我从livecd里进去，把系统打包，并对新硬盘进行分区。然后拆机换硬盘，还是从livecd进去，把新硬盘格式化，把原来的硬盘挂上去，把打包的系统解压到新的分区里，并初始化一些系统的设定，把用户数据拷进去。换硬盘不换系统。这个当时没记录下来。后来有一次手痒，重新编译了glibc，把其它的local都去掉，只留下中文的。可是这一次搞了有问题，系统总有点莫名其妙的问题。
06年，我就想换个系统算了。找人刻了张os9.2的盘，自己刻了张netbsd的盘。装双系统。
os9.2可以用微软的office 2001，还有ie5.5，不过都不是很好用。最爽的是可以用很多做图软件，photoshop,coredraw,illustrator等等啊。当年在合肥还帮很多同学处理过照片，因为6级考试要上传的图片要求是10k以下，很多人压到10k都看不清了，我用photoshop压到10k还能看清人.^_^.
