发现Youtube上有一个视频叫Evolution of clusterProfiler, 是Landon Wilkins用Gource做的。于是我也来玩一下，看一下自己这几年码代码的过程。
不记得是什么时候知道统计之都的，但我记得最早知道的是太云，因为我用了他写的corrplot包。后来统计之都最早接触的也是太云，他给我写邮件问我能不能帮忙校对《ggplot2：数据分析与图形艺术》，从此开始和太云变成了网友。
我在暨大的时候，太云曾经邀请我去China-R会议做报告，但我觉得自己没什么好分享的，GOSemSim这个包是硕士的时候做的，不好去讲之前做的东西。而当时我写的另一个包clusterProfiler，纯粹是因为大量做富集分析的工具都是针对模式生物，而我们实验室有做各种细菌；另外有一些工具，背景设置是有问题的。自己实现一个包，不受别人的限制。即便是这个包现在受到了一定的认可，比如BioC 3.3中有个debrowser的包使用了clusterProfiler，而在BioC 3.4中又有个新包bioCancer也使用了clusterProfiler；再比如这次在北京，有好几个参会的人员在茶歇时问了clusterProfiler的问题。但始终觉得这只是个实用性的包而已，算法是别人的，而且已经比较老了，类似的工具简直就是成百上千。所以也是不好意思拿出来讲的。所以我拒绝了太云的邀请，一直也没有参加China-R的会议。
今年是第九届China-R会议，这次会议规模很大，有22个分会场，超过100个演讲嘉宾，参会人数超过4000人。这一次刚好有个Bioconductor的分会场，Matt写信给我，说我写过几个Bioconductor包，他本人喜欢我的ChIPseeker包，问我能否在会上分享与Bioconductor包相关的经验。这是Bioconductor在中国的首秀，我欣然接受，当然也是因为这两年我写了ChIPseeker和ggtree，我自己觉得还拿得出手🙈。
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- 赋值
从一开始学R就知道R的赋值符号和别的语言不一样，用的是<-，虽然=也用，很多书会告诉你两者是一样的，完全通用，不过用R的人习惯也推倡用<-。所以我基本上就抛弃用=号了，反正在ESS里用shift+-就会自动输入<-，也是很方便的。直到有一天，我发现在switch里，必须用=号，而不能用<-，才发现坑爹啊，这两符号是不一样的。
刚看完《Introduction to Scientific Programming and Simulation Using R》这本书，
第一部分是R编程入门； 第二部分是数值计算，主要是解方程，求积分和优化；第三部分是概率和统计，主要讲概率、随机变量等概念和参数估计； 第四部分是simulation，主要讲Monte Carlo积分和方差降低。
读研时买了很多书，大部分都没时间看，《什么是数学》就是其中的一本。 这两天翻看了一点。
《第二章：数学中的数系》讲到了当年的伟大发现，一个正方形的对角线与它的边是不可公度的。而由不可公度线段，引入的无理数概念，引入负数，在17世纪都是个另人不安的事情，无理数是个巨大的飞跃，
73页中的图10,给出了 $\sqrt{2}$的几何作图。
我用R尝试把它画出来：
