Scientific Report上有一篇文章是抄袭的,然而杂志最终决定不撤稿,而被抄的人是Johns Hopkins的,于是jh的人全都要离开Scientific Report的编委。我也被人抄了不撤稿,然而我人微言轻,不单被编辑部欺负,还要被我们国内生信界的网红欺负。

SR与jh的事情,我和BMC的故事,是相似的,我们可以想像这样的学术界惨剧比想像中的要多。学术圈,真是有时候得呵呵哒。

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we’re talking about people who already are skating on the ethical edge (as scientists, we should always respond to serious criticism; if we don’t, that’s bordering on ethical violation already) – Andrew Gelman对此事的评论

我原以为邓岳是个学生,我的本意是要给他一个教训,制止这种行为,我不出来给他这个教训,早晚他也会为自己的投机付出代价,而且如果以后出现多次抄袭,直接会导致无法继续在学术界生存。后来我发现他还是个讲师,我觉得更不应该了,编辑部必须要对这件事做出处罚。这就是我的本意,让邓岳认识到错误,并为此付出应有的代价。

搞得我像祥林嫂一样到处找人说

然而编辑一直不做为,就逼得我只能借助于舆论,我本无意于去网上传播这件事,我写的博客,都是针对编辑部,最后我对编辑提议的处理方式表达不满之后,编辑就消失了,再也不回应邮件。我只能再写博客,再发动舆论,联系之前高调出来说撤稿了43篇文章的那些编辑,推特上也骚扰他们。微博上也AT西电官方微博,求转发之类的。虽然我没有想去闹大事情(尼马我也不想花时间扯这些蛋啊),但BMC就是逼着我跟他斗,而事情闹越大,对抄袭的人来说,越是不利,搞不好学术界就不用混了。谁都不傻,所以终于坐不住给我写信。

其中说到“1、2月份和您邮件沟通”,只是说了按照CRAN policy改了代码,并把我列为作者,而后面我回应把我名字从软件包作者中去掉而已。

他的邮件大概讲了和编辑并无操作,软件包已经按要求更新,犯错是源自于无知。

这事最后怎么处理?

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50%的利润,它就铤而走险;

100%的利润,它就敢践踏一切人间法律;

300%的利润,它就敢犯任何罪行,甚至绞首的危险.

–马克思 《资本论》

ppiPre抄袭GOSemSim,然后我发现他还发了一个叫HPOSim的R包,又是语义相似性度量,我的第一反应是必须还抄我的,他要是有能力写出来,就不会抄GOSemSim了。然而我看了一下代码,确实不是抄我的!这他妈就奇了怪了!

必须还是抄的!

做语义相似性度量也就那么几个包,我看了一遍之后,发现HPOSim抄了DOSim,你妹啊,用心良苦,同样/相似的东西换不同的包来抄!抄袭惯犯了,事实证明,走捷径的人,是不可能好好走路的,一旦尝到了甜头,必然是铤而走险!

以下两个截屏,大家感受一下,左边是HPOSim,右边是DOSim:

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抄袭的是西安电子科技大学的讲师,靠着两三篇抄袭的文章,已经是副教授了。

这种抄袭的事情就应该暴光,这个事件中,更可恶的是BMC,BMC这种保护抄袭的行为更应该暴光,大家不要再给BMC送钱了,还不如发PLoS One。

公众号有人评论说:

这竟然也被捕捉到了,确实他在2012年的时候,就在copy我的代码,然后打R包的时候,还请教了我:

抄了我的代码,之后厚颜无耻地感谢我说学了很多东西,他的良心真的不会痛吗?

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编辑部的恶才是最大的恶!

大家是否还记得2015年BioMed Central高调地撤稿了43篇文章,站在道德制高点对审稿过程进行了指责,吐了学术不端一脸口水?

就在这个时候,我写信去BMC Systems Biology告别人抄袭,编辑部信誓旦旦,他们对这种事情是非常认真对待的,然而接下来的剧情却反转了,在我证据甩他们一脸的时候,他们拖着不处理,拖多久呢,超过1年!一直在给抄袭者洗地,最好在没有告知我的情况下,静悄悄地出了个所谓的erratum

erratum是什么?字典里这样写:

erratum |ɛˈrɑːtəm|
noun (pl.errata |ɛˈrɑːtə| )
an error in printing or writing.

我告的是抄袭,plagiarism:

plagiarism |ˈpleɪdʒərɪz(ə)m|
noun [ mass noun ]
the practice of taking someone else's work or ideas and passing them off as one's own. 

结果plagiarism到了编辑部那里变成了erratum.

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ppiPre抄袭了GOSemSim的代码,证据当然非常充分,比对一下代码就知道了,我在Proper use of GOSemSim一文中,做出了一些比较,另外也可以参考github页面,github记录了ppiPre被暴光抄袭之后所做的修改。 从我给BMC Systems Biology的编辑反馈这件事开始,在这铁板钉钉的事实面前,编辑拖了整整一年,而这一年时间过去了,ppiPre仍没有被编辑部受理。从最早反应这件事情,编辑信誓旦旦说他们很重视这种事情,到后面对我的邮件视而不见,我愿意相信编辑部处理这些事情,需要时间,他们有自己的规则,但一年的时间,不回邮件,冷处理以淡化此事,这绝对不是应该有的规则。 在编辑一直无视我的情况下,我写出了Proper use of GOSemSim一文,列举了一些一模一样的代码,并告知CRAN,当ppiPre被CRAN移除时,我写信给编辑,这时候,编辑告诉我说他们准备要去联系作者了,这时候已经过去半年了,是的!你没有看错,半年过去了,编辑说他们还没去联系作者!我是不相信的。必然是联系了之后,有某些不为人知的原因,所以编辑态度反常,对抄袭这种打鸡血的事情,不断在打太极。

再过二个月,ppiPre的作者邓岳给我写了信:

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Guangchuang Yu

a senior-in-age-but-not-senior-in-knowledge bioinformatician

Postdoc researcher

Hong Kong