圣诞节期间，一个个在@微信官方，要加圣诞帽，这让人想起了以前：
今天是马化腾的生日，转发5个群，自动开通一个月的QQ会员
这班玩QQ长大的孩子，现在变成了玩微信的油腻中年了。
做为biobabble公众号的粉丝，我觉得你们是有能力用两三行R代码来给自己加个帽子的。由于我在过圣诞节，所以这篇文章没有能够及时推送出来，就当马后炮吧，不合时宜地调侃一下大家。
周日是港大医学院的198届毕业典礼，Y叔要去参加，今年也正好是医学院130周年，做为画图界的传说，我决定画一个蛋糕。
要画蛋糕，这有何难，我们有emojifont啊，还记得《emojifont新功能（有视频哦）》一文中的geom_emoji图层吗？
meme无非是照片上加两行字，meme这个包本来是练手之作，用来模拟ggplot2的api。结果我后面又实现了字体阴影效果，这次我又带来了外部字体支持。
加载外部字体在R上面主要有extrafont和showtext两个实现，特别是showtext用起来还是非常简单的。我在meme包里写了font_import函数，内部就是用showtext，只是简单的包装了一下，这样小白用户可以直接下个字体就开撸。有阴影效果，有搞笑字体，就万事具备了，这俨然是个专业的meme工具了。
取子集对于进化树可视化来说是非常常见的，我们要区分内部节点和外部节点，我们也可能想针对某些特点的节点进行注释。
ggplot2现在所有图层都不支持直接取子集，所以呢ggtree就自己定义了一些修改的图层，包括geom_text2, geom_label2, geom_point2 和 geom_segment2，这些图层和ggplot2的版本唯一差别就是支持取子集。这样对于我们做注释来说，就更方便了。
比如说我想给内部节点打点，可以用：
ggtree(tree) + geom_text2(aes(label=label, subset=!isTip), hjust=-.2) +
geom_point2(aes(subset=!isTip), color="red", size=3)
我这个公众号不像大多数所谓的生信从入门到精通的各种其实只是搬运点入门教程的群众喜闻乐见的公众号。正如我在《为什么要开这个公众号》里说的，这是小众的，有个人色彩的各种原创文。我不可能像其它公众号一样招两小弟当客服，很多人在公众号后台向我扔了许多问题，由于个人精力有限，只能优先解答「知识星球」的问题，上次写的《同一数据多变量分组的boxplot?》，图虽然简单，却穿着好多件马甲，而我把它扒光了给你看🙈
上面这个图，你看着高大上吧，我都可以吐它一脸口水。每一个有灰色背景的图，在x轴上violin都够到边界了，其实所有的violin都够到了，这证明什么？每个violin之间其实不可比较！你能想像几个独立的数据，在统一的bin width情况下，画density curve，竟然最高点都一样高吗？显然可能性几乎为0。这个如果使用ggplot2的话，可以使用scale='width'强制拉成一样高，但我不推荐，正如我前面说的，不可比较了。默认参数scale='area'，积分面积一样，和density curve一样解析，另外的参数scale="count"，高度与计数同比例，和histogram一样解析，而scale='width'强制拉成一样高，如果没有在显眼处说明，误导性太强。
画这种图也可以手工拼，这样就简单了。在你需要的情况下，加个灰色背景嘛，最后拼图嘛。当然拼图不一定要在illustrator里拼，比如你用grid，先画好坐标轴，然后水平上定义几个一样大的viewport，每一个violin都画在相应的viewport里面，对于画图函数来说，viewport就是整个画布了（虽然只是画布里的一块区域），所以你要么画violin，要么在画之前先画个矩阵，一路画下来，代码可以直接生成这样的图，但这图每一个violin都是独立画的（当然也不是完全独立，每一个水平上的ylim是有统一的），就算代码一步生成，也跟illustrator里拼没两样。
这里我要教你用ggplot2自动生成，其实解决思路早已推送过，请看《facet_plot：加图层到特定分面，方法二》，也正如我在《什么！你的图上有一双看不见的手》里说的，你们以为我在教ggtree，其实同时在教ggplot2。
正如我在《用R画meme ;)》里说的，meme包就可以拿来画，当然这个包是设计来画meme的，所以文本只会打在中间，如果你想在右下角之类的，不好意思，我没提供选项让你调文本位置，氮素，meme依然是你的好帮手，怎么说呢，meme不单能帮你读图片，还能用grid画出来，这意味着你可以用grid.text随便加个文本就OK了。
实例演示一发：
library(meme)
u <- system.file("angry8.jpg", package="meme")
x <- meme(u)
print(x)
grid.text("biobabble", x=.9, y=.05,
gp=gpar(col='white', cex=1.2))
After the release of meme package, I received several feedbacks from users.
The most usefule one is the comment on my blog post:
Greetings Mr. Yu,
I am very happy that this package exists. Thank you for making it! I would like to request a feature, to ensure the package is able to compete with professional meme-creation tools like memegenerator and paint.net. Since memes often use the font Impact, in white and with black outline, I believe the package would be more powerful if it also did that automatically.
Regards,
The words, ‘compete with professional meme-creation tools’, stimulated me to develop text plotting with background outline effect.
Now this feature is available in meme v>=0.0.7, which can be downloaded from CRAN.
